Honkilahden nykyinen Pyhän Mikaelin kirkko on vuodelta 1759. Rakentajana oli luvialainen Tuomas Samuelinpoika Rahvonius. Kirkossa on myöhemmin tehty runsaasti muutostöitä. Lehtereiden rakentamisen myötä länsisuomalainen pitkäkirkko on muuttunut lähes ristikirkoksi. Alttarilla on Gunnar Forsströmin vuonna 1934 tekemä lasimaalaus Kristus Getsemanessa. Kirkkoon mahtuu 400 henkeä.

Kirkon kupeella oleva vuonna 1771 rakennettu erillinen kellotapuli edustaa ajalle tyypillistä lounais-suomalaista rakennustyyliä. Myös sen rakensi Tuomas Rahvonius. Rakennus on hirsirakenteinen, lautapaneelivuorattu ja saumapeltikatteinen kuten kirkkokin. Tapuliin on sijoitettu kaksi Tukholmassa valettua kelloa, joiden valmistusvuodet ovat 1777 ja 1782. Kirkonmäen miljööseen kuuluu lisäksi luonnonkivistä rakennettu makasiini.